Cindy Boer

Cartilage Thickness and Hip Osteoarthritis | 73 2.1 Table 1: Results from the minimal Joint Space Width genome-wide association study; discovery, replication and joint meta-analysis Discovery Replication Joint Meta-analysis SNP Chr AE NEA EAF Beta SE p-value Beta SE p-value Beta SE p-value N Locus rs11880992 19 A G 0.40 0.10 0.01 9.1x10 -14 0.09 0.03 1.5x10 -03 0.10 0.01 1.1x10 -14 15,234 DOT1L rs2862851 2 T C 0.49 -0.07 0.01 2.9x10 -08 -0.06 0.02 4.8x10 -04 -0.07 0.01 1.6x10 -10 18,366 TGFA rs10948155 6 T C 0.67 0.08 0.01 1.2x10 -09 0.05 0.02 1.5x10 -02 0.07 0.01 4.1x10 -10 18,366 SUPT3H-RUNX2 rs12206662 6 A G 0.07 -0.19 0.03 7.9x10 -09 -0.09 0.04 7.3x10 -03 -0.15 0.02 6.0x10 -10 16,856 SUPT3H-RUNX2 rs10471753 5 c G 0.61 0.08 0.01 1.5x10 -10 0.02 0.02 3.3x10 -01 0.06 0.01 4.9x10 -09 17,777 PIK3R1 rs2236995 4 T G 0.49 0.06 0.01 6.4x10 -06 0.04 0.02 3.2x10 -02 0.05 0.01 1.5x10 -07 18,366 SLBP rs496547 11 A T 0.34 -0.06 0.01 1.5x10 -06 -0.05 0.02 3.8x10 -02 -0.06 0.01 4.7x10 -07 16,879 TREH-DDX6 rs717433 20 T C 0.76 0.07 0.02 8.0x10 -06 0.06 0.03 8.3x10 -02 0.07 0.01 3.9x10 -06 15,234 HAO1 rs6437120 2 T C 0.50 -0.06 0.01 4.0x10 -07 0.006 0.02 7.5x10 -01 -0.04 0.01 5.3x10 -06 18,365 ACVR1-UPP2 rs6592847 11 A G 0.28 0.07 0.02 3.7x10 -06 -0.01 0.06 8.1x10 -01 0.06 0.02 9.5x10 -06 13,412 NARS2 rs10495106 1 T C 0.94 0.12 0.03 6.2x10 -06 0.05 0.04 1.3x10 -01 0.10 0.02 1.2x10 -05 18,362 TGFB2 rs6429001 1 A G 0.83 0.08 0.02 3.1x10 -06 -0.006 0.04 8.8x10 -01 0.07 0.02 2.4x10 -05 15,233 RIR2 rs13148031 4 A G 0.60 0.06 0.01 9.8x10 -06 0.016 0.02 3.6x10 -01 0.04 0.01 3.7x10 -05 18,366 HHIP-GYPA rs4837613 9 c G 0.50 -0.06 0.01 2.0x10 -06 0.002 0.02 9.1x10 -01 -0.04 0.01 3.7x10 -05 16,850 ASTN2 rs2703529 17 A G 0.07 -0.11 0.02 2.9x10 -06 0.006 0.03 8.6x10 -01 -0.08 0.02 4.3x10 -05 18,366 HRN3P3 rs11045356 12 A G 0.17 0.08 0.02 4.4x10 -06 -0.05 0.04 1.5x10 -01 0.06 0.02 1.0x10 -04 15,225 PPE3A rs7739938 6 A G 0.03 -0.31 0.07 1.1x10 -06 -0.03 0.03 2.5x10 -01 -0.08 0.02 1.3x10 -04 17,164 CITED2