Chapter 8 256 Hoofdstuk 3 concludeert dat samengestelde biomarkers geen toegevoegde voorspellende waarde hebben in vergelijking met PD-1T TILs en TIS als individuele biomarkers. Dit was zowel voor het primaire eindpunt op 6 maanden, als voor het secundaire eindpunt op 12 maanden zonder progressie van ziekte. PD-1T TILs en TIS identificeerde patiënten met een langdurige respons van meer dan 12 maanden met een hoge sensitiviteit (86% en 100%) en hoge NPV (95% en 100%). Patiënten die geen of weinig baat hadden bij behandeling met anti-PD-1 therapie werden het meest nauwkeurig geïdentificeerd door PD-1T TILs (specificiteit PD-1T TILs 74% versus TIS 39% op 12 maanden). Hoofdstuk 4; Een PD-1T signatuur dat geschikter is voor de dagelijkse diagnostiek Hoofdstuk 2 beschrijft een digitaal PD-1 IHC algoritme dat het aantal PD-1T TILs kan kwantificeren in tumorweefsel. Echter is deze methode complex en wordt beperkt door verschillende – voornamelijk technische – vormen van bias, waardoor de implementatie van deze biomarker in de diagnostiek lastig is. Voorbeelden van bias zijn pre-analytische factoren, zoals het voorbereidingsproces van weefsel tot coupe en analytische factoren, zoals de validatie van antilichamen en het gebruik van verschillende IHC-kleuring apparatuur. Bovendien vereist het digitaal kwantificeren van PD-1T TILs handmatige annotatie van de tumorgebieden. Hoofdstuk 4 onderzocht een betrouwbare methode om het signaal van PD-1T TILs in tumoren te kunnen weergeven. Een voorwaarde is dat deze methode ook eenvoudig moet kunnen worden toegepast in de dagelijkse praktijk. Een optimaal platform voor de evaluatie van biomarkers in diagnostische toepassingen moet gevoelige, specifieke en reproduceerbare resultaten opleveren. Tegelijkertijd is er voor laboratoriumwerk en data-analyse een minimale complexiteit vereist. Het Nanostring nCounter-platform heeft aangetoond te voldoen aan deze criteria, zelfs bij het verwerken van lage kwaliteit RNA-monsters verkregen uit FFPE- (formalin-fixed, paraffin-embedded) materiaal. Deze techniek hybridiseert fluorescerende barcodes rechtstreeks aan nucleïnezuursequenties, waardoor individuele telling mogelijk is zonder amplificatiestap. Bovendien zijn Nanostring analyses gevoeliger in vergelijking met microarrays en RNA-sequencing en heeft het platform eerder zijn klinische toepasbaarheid aangetoond. Hoofdstuk 4 beschrijft de ontwikkeling en de validatie van een mRNA genexpressie signatuur dat de PD-1T TIL status in tumoren detecteert en een voorspelling maakt van de klinische uitkomst van stadium IV NSCLC patiënten behandeld met anti-PD-1 therapie. Hierbij werd gebruik gemaakt van het Nanostring nCounter-platform. De resultaten van deze studie toonden aan dat de PD-1T TIL IHC-biomarker succesvol kon worden omgezet in een mRNA genexpressie signatuur. De PD-1T genexpressie
RkJQdWJsaXNoZXIy MTk4NDMw