17 Samenvatting In Hoofdstuk 3 hebben we gedurende een jaar twee microbiële gemeenschappen in anoxische kustsedimenten gemonitord onder verschillende methaan-, stikstof- (nitraat en ammonium) en sulfideconcentraties. Hierbij hebben we vastgesteld dat de Gammaproteobacteriën de meest dominante groep vormden. De stikstofverwijderingsprocessen verschilden tussen de twee systemen: de oligotrofe bioreactor stimuleerde dissimilatoire nitraatreductie tot ammonium (DNRA), terwijl denitrificatie domineerde in de eutrofe bioreactor. Methanotrofen in de oligotrofe systemen (inclusief biofilmgroei) bestonden uit een diverse, maar nog niet goed beschreven, geslacht van Methylomonadaceae, namelijk Methylovulum, en subgroep KS41. Deze twee aerobe methanotrofen concurreerden om nitraat met de belangrijkste aanjager van DNRA, “Ca. Methanoperedens BLZ2” spp. Bovendien selecteerde het oligotrofe systeem voor twee nieuwe MAGs Pseudomonadales IMCC2047 en Rugosibacter. Beide MAGs codeerden een divergent membraangebonden mono-oxygenase (CuMMOs), die mogelijk verantwoordelijk is voor de afbraak van korte alkanen. De eutrofe systemen selecteerden voor beter beschreven Methylomonadaceae-soorten, Methylomonas en Methylobacter. Het onderzoek uit dit hoofdstuk benadrukte de metabole veelzijdigheid van microaerofiele methanotrofen uit de familie Methylomonadaceae en hun vermogen om om te gaan met sulfide, lage zuurstofconcentraties en met de mogelijkheid tot denitrificatie. In Hoofdstuk 4 onderzochten we de flexibiliteit van een stabiele anoxische co-cultuur van sulfide-oxiderende denitrificeerders, anammox en nitraat-/ nitrietafhankelijke anaerobe oxidatie van methaan (N-DAMO) partners om om te gaan met stikstofgebrek, en sulfide- en stikstofmonoxide-stress. Dit onderzoek bootste de dynamische veranderingen na die mogelijk optreden in kustsedimentcondities, zoals beschreven in Hoofdstuk 3. Het omzetten en verwijderen van ammonium resulteerde in het verdwijnen van “Ca. Nitrobium versatile” en anammox-bacteriën uit de initiële co-cultuur. De DNRA-activiteit, voornamelijk uitgevoerd door “Ca. Methanoperedens”, was niet in staat om de anammox-activiteit te ondersteunen. Na herintroductie van ammonium werd “Ca. Methylomirabilis lanthanidiphila” vervangen door “Ca. Methylomirabilis tolerans” en anammox “Ca. Kuenenia stuttgartienses” werd vervangen door “Ca. Scalindua rubra”. De toegevoegde sulfide en stikstofmonoxide verrijkten
RkJQdWJsaXNoZXIy MTk4NDMw